Aldo Baerten jest pierwszym flecistą Antwerp Symphony Orchestra, współpracującym z takimi dyrygentami jak Elim Chan, Edo de Waart, Philippe Herreweghe, a wcześniej również z Jaap van Zweden.
Jest profesorem fletu w Królewskim Konserwatorium w Antwerpii oraz w Hogeschool der Kunsten Utrecht (Holandia). Prowadzi kursy mistrzowskie na czterech kontynentach, w tym w prestiżowych uczelniach, takich jak Royal Academy of Music w Londynie. Wcześniej wykładał również w Sydney Conservatorium, Hochschule für Musik w Münster oraz Hochschule für Musik w Hanowerze. Od października 2018 roku związany jest także z Hochschule für Musik und Theater Köln/Aachen.
Regularnie współpracuje z takimi zespołami jak Chamber Orchestra of Europe, Mahler Chamber Orchestra, I Fiamminghi, European Union Opera, Arctic Philharmonic, Swedish Chamber Orchestra oraz Rotterdam Philharmonic Orchestra.
Studia ukończył w Królewskim Konserwatorium w Brukseli, gdzie kształcił się pod kierunkiem prof. Petera-Lukasa Grafa (Musikhochschule Basel), uzyskując dyplom solisty. Doskonalił swoje umiejętności również u prof. Philippe’a Boucly’ego (Monachium) oraz Gaby Pas van Riet (Stuttgart). Jest laureatem wielu międzynarodowych konkursów, m.in. Maria Canals Competition w Barcelonie (2001), konkursu w Wiedniu (2004), Axion Classics, Quantz oraz Belgian National Instrument Competition.
Otrzymał nagrodę Alex de Vries Prize, SABAM Award oraz prestiżową Caecilia Prize przyznawaną przez belgijską prasę muzyczną.
Jako solista występował z wybitnymi orkiestrami, m.in. Südwestdeutsches Kammerorchester, RSO Basel, National Orchestra of Belgium, Walloon Chamber Orchestra, Royal Flemish Philharmonic, Las Vegas Symphony oraz Kansas City Symphony, współpracując z dyrygentami takimi jak David Stern, Tadeusz Czarniecki, Peter Rundel, Grant Llewellyn Octors, Zsolt Nagy, Takuo Yuasa, Steven Byess, Eivind Aadland, Robert Wilson oraz Sakari Mäkkilä.
Jest regularnym gościem międzynarodowych festiwali muzycznych, gdzie występuje z uznanymi artystami, takimi jak José van Dam, Martin Helmchen, Severin von Eckardstein, Alexei Ogrintchouk czy Jef Neve.
Dokonał licznych nagrań dla wytwórni Cypres, Phaedra, ECM, Pentatone, PMP oraz Principal Chairs. Jego nagranie utworu Franza Schuberta „Introduction, Theme and Variations on Trockne Blumen”, zrealizowane wspólnie z pianistą Martinem Helmchenem, zostało nominowane do BBC Music Prize w kategorii najlepsze nagranie muzyki kameralnej roku 2010.
W latach 1989–1993 pełnił funkcję pierwszego flecisty w European Union Youth Orchestra pod dyrekcją Claudio Abbado, współpracując z takimi mistrzami batuty jak Bernard Haitink, Vladimir Ashkenazy, Vaclav Neumann, James Conlon oraz Jeffrey Tate. Był również pierwszym flecistą Belgian Chamber Orchestra oraz MDR-Sinfonieorchester Leipzig.
Organizowany przez niego International Flute Seminar Bruges należy do najważniejszych letnich kursów fletowych dla profesjonalistów i amatorów. Aldo Baerten jest artystą marki Powell Flutes oraz regularnie zasiada w jury międzynarodowych konkursów fletowych, takich jak International Flutonicon Flute Competition, Axion Classics, Lyons Music Competition, NFA Young Artists Competition, Yamaha Music Foundation oraz Biwako Competition w Japonii.
Jego studenci zajmują obecnie stanowiska w orkiestrach i konserwatoriach w Belgii oraz za granicą.